Он выполнял задание Сарутоби, а роль предателя на себя взял, чтобы не очернять клан, который мало того, что устроил атаку девятихвастого на коноху, так ещё и готовились к перевороту
Обито действовал самостоятельно, а клан Учиха был под подозрением... потом он же и помог Итачи расправиться с сотрудниками полиции в лице бойцов клана, а Сару как обычно всё проебал... Хотя Третий Хокаге всё ещё хотел провести переговоры с кланом Учиха, Данзо понимал, что выхода, способного сохранить жизни Учих, уже не было. Он объяснил это Итачи и поставил его перед выбором: поддержать переворот клана, что приведет к его полному истреблению (включая и Саске), в разгорающемся конфликте, или же согласиться на миссию по уничтожению клана собственными руками до того, как сам переворот начнется, и получить возможность пощадить младшего брата. Итачи выбрал своего брата.
Хотя Третий Хокаге всё ещё хотел провести переговоры с кланом Учиха, Данзо понимал, что выхода, способного сохранить жизни Учих, уже не было. Он объяснил это Итачи и поставил его перед выбором: поддержать переворот клана, что приведет к его полному истреблению (включая и Саске), в разгорающемся конфликте, или же согласиться на миссию по уничтожению клана собственными руками до того, как сам переворот начнется, и получить возможность пощадить младшего брата. Итачи выбрал своего брата.